工藤()新一是全国著名的高中生侦探，在一次追查黑衣人犯罪团伙时不幸被团伙成员发现，击晕后喂了神奇的药水，工藤新一变回了小孩！新一找到了经常帮助他的阿笠博士，博士为他度身打造不少间谍武器。为了防止犯罪()团伙对他进行()报复，新一决定隐姓埋名，暗中追查()他们，希望能得到解药。一()日，新一 的女友毛利兰来到了阿笠博士的家寻找()男友()的下落，被小兰撞见()的新一情急之下编造了自己名叫江户川柯南，随后柯南寄居在了小兰家。小兰的父亲毛()利小五郎是一名私家侦探，新一可以籍着和他一起四出办案一起追查黑夜人的下落。柯南在小学认识步美()等小()学生()，他们一起()组织了一个少年侦探团，向罪犯宣战！